Маттиас Майерхофер родился в Граце (Австрия).
Победитель и призёр ряда конкурсов по импровизации и интерпретации – им/Иоганна Пахельбеля в Нюрнберге (1-я премия, 2007), им. М.К.Чюрлёниса в Литве (2-я премия, 2003), им. И.С.Баха в Арнштадте и международном конкурсе в Ниймегене, Нидерланды.
Окончил Высшую школу музыки во Фрайбурге с дипломом «солист-органист». До этого обучался импровизации, интерпретации, клавесину, бассо континуо, органной и фортепианной педагогике в высшей музыкальной школе им.Ф.Мендельсона-Бартольди в Лейпциге. Его педагогами были Курт Нойхаузер, Арвид Гаст, Мартин Шмединг, Вольфганг Церер, Лоренцо Гьельми и Андреа Маркон.
Ведёт активную концертную и фестивальную работу. Участвовал в международных фестивалях по всему миру, в т.ч. фестивале Антона Брукнера в Австрии, фестивале Мендельсона и фестивале Баха в Лейпциге, в международных фестивалях в Штутгарте, Ансбахе, Нюрнберге, Риге, Берлине, Бирмингеме, Осаке.
Выступает как солист и ансамблист. Сотрудничает с известными коллективами: Дрезденским Кройцхором, Лейпцигским хором университета, хором Гевандхауса в Лейпциге, с хором церкви св.Фомы в Лейпциге, Государственной капеллой Дрездена, Государственной капеллой Галле.
С 2005 по 2009 был музыкальным директором и органистом в церкви Св.Альбертуса во Фрайбурге. С 2009 является преподавателем в высшей музыкальной школе в Лейпциге, где преподает орган и импровизацию.
С 2016 является титулярным органистом Фрайбургского кафедрального собора.